
의료비 세액공제 실손보험금 빼고 신청 방법은 홈택스 연말정산 간소화의 의료비 화면에서 보험금 수령액을 확인해 본인 부담액만 공제 신청하는 것이며, 병원비 300만 원에 보험금 100만 원이면 공제 대상은 200만 원입니다. 2025년 귀속 기준입니다.
병원비를 낸 뒤 실손보험(실비보험)으로 일부를 돌려받은 직장인이 대상입니다. 순서는 신청 단계, 계산 예시, 부양가족과 사후 수정, 한도와 안 맞는 경우, 자주 묻는 질문입니다.
⏱ 10초 요약
- 소득세법 시행령 제118조의5: 실손보험금으로 돌려받은 금액은 공제 대상 의료비에서 제외
- 조회 경로: 홈택스 → 조회발급 → 연말정산 간소화 → 의료비
- 예시: 총급여 4,000만 원, 지출 300만 원, 보험금 100만 원이면 공제액 12만 원

실손보험금 빼고 신청하는 순서
핵심은 병원이 낸 자료가 아니라 내가 실제로 부담한 금액을 올리는 것입니다. 병원 자료는 병원이 보고한 지출액 그대로 나오기 때문에, 보험사에서 돌려받은 돈이 이미 빠져 있지 않습니다. 국세청 안내에 따르면 간소화 서비스의 의료비 항목에는 의료비와 실손보험금이 따로 표시됩니다.

- 홈택스에 로그인해 본인 인증을 합니다(공동·금융인증서, 휴대폰 등).
- 조회발급 → 연말정산 간소화로 들어가 의료비 항목을 엽니다.
- 병원 지출 합계와 실손의료보험금 수령액을 나란히 확인합니다.
- 회사에 내는 소득·세액공제신고서의 의료비 칸에 지출액에서 보험금을 뺀 금액을 적습니다.
- 보험금이 조회되지 않으면 보험사에 문의해 자료를 확인합니다. 보험사가 국세청에 보고한 자료만 화면에 나옵니다.
의료비 세액공제 실비 처리에는 별도 증빙이 따로 필요하지 않다고 국세청이 안내합니다. 올해분 간소화 서비스 개통 일정은 국세청 공지에서 확인하는 방법이 있습니다.
직접 계산해 보는 공제액
같은 병원비라도 보험금을 빼느냐에 따라 공제액이 두 배 넘게 달라집니다. 가정은 총급여 4,000만 원, 본인 의료비 300만 원 지출, 실손보험금 100만 원 수령입니다. 의료비 세액공제 계산은 총급여의 3%를 넘는 부분에 15%를 곱하는 구조입니다(2025년 귀속 기준).
| 구분 | 보험금을 뺀 경우 | 빼지 않은 경우 |
|---|---|---|
| 신고 의료비 | 300만 − 100만 = 200만 원 | 300만 원 |
| 총급여 3% 문턱 | 4,000만 × 3% = 120만 원 | 120만 원 |
| 초과분 | 200만 − 120만 = 80만 원 | 180만 원 |
| 세액공제(15%) | 12만 원 | 27만 원 |
※ 2025년 귀속 기준 계산 예시, 국세청 안내와 소득세법 기준(가정 금액). 실제 금액은 개인 상황에 따라 달라집니다.

같은 조건으로 계산하면 보험금을 빼지 않았을 때 세액이 15만 원 더 나오고, 이 차이가 과다공제입니다. 국세청 자료에도 6월 지출 100만 원, 7월 보험금 70만 원이면 공제 대상은 30만 원이라는 비슷한 예시가 있습니다.
👉 다음 글: 대학 등록금 교육비 세액공제 15% 한도 900만원 계산
부양가족 몫과 사후 수정
부모님·자녀의 보험금은 그 가족이 동의해야 내 화면에 나옵니다. 기본공제 대상 부양가족이 동의하지 않으면 수령액이 조회되지 않습니다. 국세청 안내의 동의 경로는 홈택스 → 조회발급 → 연말정산 간소화 → 자료제공동의 신청 → 소득·세액공제 자료제공 동의 신청이며, 가족이 PC나 모바일 앱에서 본인 인증 후 신청하면 바로 조회됩니다.
연말정산을 마친 뒤 보험금이나 본인부담 상한제 사후환급금이 생기는 경우도 있습니다. 국세청 보도자료(2026년 1월 23일)에 따르면 2025년 지출분의 사후환급금은 2026년 1월 연말정산에서 차감하고, 2024년 이전 지출분은 해당 연도 의료비에서 빼서 소득세를 수정신고합니다.
사후환급금 때문에 의료비 공제를 고치는 수정신고에는 가산세가 없습니다. 환급 절차와 신청 기한은 상황별로 달라 국세상담센터(126)에 확인이 필요합니다.
근로소득 원천징수영수증에 반영된 금액이 틀렸다면 종합소득세 신고 기간에 바로잡는 방법이 있습니다.
한도와 안 맞는 경우
의료비 세액공제 한도는 대상에 따라 다릅니다. 일반 부양가족은 연 700만 원까지, 본인과 65세 이상·장애인·6세 이하 가족 의료비는 한도 없이 공제됩니다(소득세법 기준, 2025년 귀속). 난임시술비는 공제율 30%, 미숙아·선천성 이상아는 20%로 따로 계산합니다.
이 방법이 맞지 않는 경우가 두 가지 있습니다. 첫째, 기본공제 대상이 아닌 가족의 병원비는 공제 대상 자체가 아닙니다. 둘째, 보험금이 국세청에 보고되지 않았다면 화면에 없어도 받은 금액은 직접 빼야 합니다.
의료비 세액공제 부부 합산이 궁금하다면, 공제는 지출한 사람이 아니라 기본공제를 받는 쪽 기준으로 보는 규정이 있어 간소화 화면의 부양가족 조회를 먼저 확인하는 방법이 있습니다.

자주 묻는 질문
보험금을 빼지 않고 신고하면 어떻게 되나요?
과다공제로 세금을 추가로 내야 할 수 있습니다. 중복·과다공제를 신고 기간 이후 고치면 과소납부 세액의 10%와 납부지연 가산세(하루 0.022%)가 붙는다고 국세청이 안내합니다.
보험금을 다음 해에 받았다면 언제 빼나요?
해당 지출 연도의 의료비에서 뺍니다. 이미 공제받았다면 수정신고 대상일 수 있어 국세상담센터(126)에서 본인 경우를 확인하는 방법이 있습니다.
안경이나 산후조리원 비용도 보험금을 빼나요?
보험금을 받은 항목이라면 똑같이 뺍니다. 산후조리원은 출산 1회당 200만 원까지가 대상이라는 조문이 있어, 한도와 보험금을 따로 따져야 합니다.
출처: 국세청 광산세무서 자주 하는 연말정산 실수 오답노트, 국세청 해운대세무서 실손의료보험금 수령액 홈택스 조회 안내, 국세상담센터 자주묻는Q&A
작성 기준일: 2026-11-11 · 기준 금액·요율은 해마다 바뀔 수 있으니 공식 안내로 다시 확인하세요.

